大连海事大学综合运输研究所是在多年科学研究和人才培养的基础上，经学校批准于2011年11月2日正式成立的交通运输科学研究和技术咨询机构。研究队伍由交通运输工程学院、航海学院、交通运输装备与海洋工程学院等单位的教授、专家联合组成。由博士生导师谢新连教授任所长。

主要研究和咨询领域：

作为交通运输部所属的唯一一所“双一流建设”大学下属的专业研究机构，综合运输研究所以科学规划和管理由公路、铁路、水路、航空等多种交通运输方式构成的现代综合运输系统为目标，深入研究各种交通运输方式的技术、经济、效率和环境友好特征，研究综合交通枢纽一体化运行组织理论与优化方法，研究区域综合交通系统用户出行方式的选择行为机理，研究影响区域综合交通网络运行效率的因素，研究综合交通运输系统运行质量的科学评价方法，为实现“畅通、高效、安全、绿色”、可持续发展的综合交通运输系统提供理论支持和技术咨询。其中运力规划、船舶投资技术经济分析、交通运输企业绩效评价、水陆联运系统规划与设计、海运风险评估与事故调查、交通运输项目建设后评价等方面是研究所目前的主要研究领域，也具有较强的科研基础和较多的研究成果。研究所已逐步向综合交通枢纽、运力、线网规划以及海铁联运关键技术研究等领域拓展。交通运输高质量评价、重大装备运输和区域物流网络构建也是进一步的研究重点和方向。